Cawangan Stor Jabatan Kerja Raya adalah sebuah cawangan yang dipertanggungjawabkan untuk mengendalikan semua pengurusan stor dari segi pemesanan, penerimaan, penyimpanan, pengeluaran dan menjaga keselamatan stor. Secara amnya, fungsi Cawangan Stor Jabatan Kerja Raya adalah semata-mata untuk memberi khidmat dalam menyediakan bekalan barang-barang yang diperlukan jabatan mengikut mutu, kualiti dan tempoh yang telah ditetapkan. Disamping itu memberi khidmat nasihat/taklimat mengenai pengurusan dan penyelenggaraan stor yang cekap dan berkesan mengikut peraturan-peraturan yang telah ditetapkan. Cawangan ini juga di pertanggungjawabkan bagi mengendali dan menguruskan pelupusan harta benda Kerajaan (Board of Survey) bagi Jabatan Kerja Raya seluruh Sabah.
Cawangan Stor Jabatan Kerja Raya juga mempunyai Stor Pusat dan beberapa cawangan-cawangannya diseluruh Sabah. Satu daripadanya terletak di Putatan dan fungsi utama Stor Putatan adalah bagi menampung keperluan bekalan barang-barang semua cawangannya. Bagi Cawangan Stor Pusat Sandakan, Tawau dan Keningau pula adalah bertujuan bagi menampung keperluan bekalan barang-barang yang diperlukan oleh daerah masing-masing dan juga menampung keperluan bagi daerah-daerah yang berdekatan dengannya. Tujuan utama pengwujudan Cawangan Stor Pusat di daerah-daerah ini adalah bagi menjimatkan perbelanjaan pengangkutan, elaun dan sebagainya.